Johan Albinus overtog apoteket efter faderens død i 1818 for 10.620 Rdl, hvoraf de 6.500 for privilegium, varer og inventar og de 4.120 for ejendommen. Bevillingen for ham udstedtes 12. februar 1819. Han solgte apoteket i 1832 til apoteker J. L. Strøyberg for 28.000 Rdl. Han købte Varmarkgaard i Sønder Stenderup Sogn ved Kolding, hvor de boede i perioden 1832-38, i 1839 boede han i Dalby Sogn og i 1843 i Bjert Sogn. Senest fra 1845 var han ejer af en lystgård Bellevue i Seest Sogn syd for Kolding. 25/5 1832 udnævntes han til kancelliråd. Samme år indsendte han en beretning til Det kgl. Nordiske Oldskriftselskab om udgravning af en borg fra oldtiden ved Aborreminde, nord for Assens. Han havde sin faster Marie Elisabeth Albinus, der var enke (født ca. 1770 i Hamborg), boende i 1845.